因應內外部環境改變需求及志業全球化發展，本會已進行組織優化與運作調整，以奠定未來永續發展的磐石。

在衛生福利部的監督下，依「社會福利業務財團法人設立許可及監督要點」之規定，由董事會監督基金會運作，做為組織治理的基礎。董事會是組織最高的治理機構，對外代表機構，董事成員以高度自律及審慎態度行使職權，以及按照相關法令、本會章程宗旨執行職務，落實創辦人理念，以傳承靜思法脈，弘揚慈濟宗門之使命。

董事會治理方面，均依法令規章召開會議，審議相關重要事項；監察人則具有法律、財會等經驗，以專業客觀的角度給於適切的建議，提升董事會議決策品質，發揮有效的監督功能。